=> Bootstrap dependency digest>=20010302: found digest-20121220 ===> Building for fasta-36.3.5.4 --- init_sw.o --- --- calcons_sw.o --- --- comp_mlib8.o --- --- init_sw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DSSEARCH initfa.c -o init_sw.o --- calcons_sw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DSSEARCH -c cal_cons.c -o calcons_sw.o --- comp_mlib8.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DCOMP_MLIB -c comp_lib8.c -o comp_mlib8.o --- compacc2_s.o --- --- lshowalign.o --- --- compacc2_s.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DCOMP_MLIB -c compacc2.c -o compacc2_s.o --- lshowalign.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DLALIGN -c mshowalign2.c -o lshowalign.o --- init_lal.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DLALIGN initfa.c -o init_lal.o --- droplal2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DLALIGN -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropgsw2.c -o droplal2.o --- calcons_la.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DLALIGN -DLCAL_CONS -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c cal_cons.c -o calcons_la.o --- init_fs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTS initfa.c -o init_fs.o --- init_fx.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTX initfa.c -o init_fx.o --- init_tfx.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTX -DTFAST initfa.c -o init_tfx.o --- drop_tfx.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DTFAST dropfx.c -o drop_tfx.o --- init_fy.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTY initfa.c -o init_fy.o --- init_tfy.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTY -DTFAST initfa.c -o init_tfy.o --- drop_tfz.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DTFAST dropfz2.c -o drop_tfz.o --- init_tfs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTS -DTFAST initfa.c -o init_tfs.o --- drop_tfs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DTFAST -DFASTS dropfs2.c -o drop_tfs.o --- calcons_tfs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DTFAST -DFASTS -c cal_consf.c -o calcons_tfs.o --- init_fm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTM initfa.c -o init_fm.o --- tatstats_fm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTM tatstats.c -o tatstats_fm.o --- drop_fm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTM dropfs2.c -o drop_fm.o --- calcons_fm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTM -c cal_consf.c -o calcons_fm.o --- mshowalign2_s.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c mshowalign2.c -o mshowalign2_s.o --- init_tfm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTM -DTFAST initfa.c -o init_tfm.o --- drop_tfm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DTFAST -DFASTM dropfs2.c -o drop_tfm.o --- calcons_tfm.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DTFAST -DFASTM -c cal_consf.c -o calcons_tfm.o --- init_ff.o --- --- scaleswtf.o --- --- init_ff.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTF initfa.c -o init_ff.o --- scaleswtf.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTF -c scaleswt.c -o scaleswtf.o --- tatstats_ff.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTF tatstats.c -o tatstats_ff.o --- calcons_ff.o --- --- init_tf.o --- --- calcons_ff.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTF -c cal_consf.c -o calcons_ff.o --- drop_tff.o --- --- init_tf.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTF -DTFAST initfa.c -o init_tf.o --- calcons_tff.o --- --- drop_tff.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTF -DTFAST dropff2.c -o drop_tff.o --- calcons_tff.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DTFAST -DFASTF -c cal_consf.c -o calcons_tff.o --- scale_sn.o --- --- init_lnw.o --- --- scale_sn.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DNORMAL_DIST -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c scaleswn.c -o scale_sn.o --- init_lnw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DGLSEARCH initfa.c -o init_lnw.o --- init_gnw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DGGSEARCH initfa.c -o init_gnw.o --- dropgnw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DGLOBAL_GLOBAL -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropnnw2.c -o dropgnw.o --- comp_mthr8.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DCOMP_THR -DCOMP_MLIB -c comp_lib8.c -o comp_mthr8.o --- work_thr2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c work_thr2.c --- pthr_subs2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c pthr_subs2.c --- compacc2_t.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DCOMP_THR -DCOMP_MLIB -c compacc2.c -o compacc2_t.o --- showbest.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c mshowbest.c -o showbest.o --- build_ares.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c build_ares.c -o build_ares.o --- re_getlib.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c re_getlib.c --- mshowalign2_t.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DCOMP_THR -c mshowalign2.c -o mshowalign2_t.o --- htime.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c htime.c --- apam.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c apam.c --- doinit.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c doinit.c --- init_fa.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTA initfa.c -o init_fa.o --- scale_se.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DLOCAL_SCORE -c scaleswn.c -o scale_se.o --- karlin.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c karlin.c --- drop_nfa.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropnfa.c -o drop_nfa.o --- wm_align.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c wm_align.c --- calcons_fa.o --- --- lgetlib.o --- --- calcons_fa.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTA -c cal_cons.c -o calcons_fa.o --- lgetlib.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c nmgetlib.c -o lgetlib.o --- lgetaa_m.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c mmgetaa.c -o lgetaa_m.o --- c_dispn.o --- --- ncbl2_mlib.o --- --- c_dispn.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c c_dispn.c --- ncbl2_mlib.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c ncbl2_mlib.c --- lib_sel.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c lib_sel.c --- url_subs.o --- --- mrandom.o --- --- url_subs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c url_subs.c --- mrandom.o --- cc -O -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -I/usr/include -c mrandom.c --- dropgsw2.o --- --- pssm_asn_subs.o --- --- dropgsw2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropgsw2.c -o dropgsw2.o --- pssm_asn_subs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c pssm_asn_subs.c --- last_thresh.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c last_thresh.c --- lsim4.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c lsim4.c --- scaleswts.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c scaleswt.c -o scaleswts.o --- last_tat.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c last_tat.c --- tatstats_fs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTS tatstats.c -o tatstats_fs.o --- drop_fs2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTS -c dropfs2.c -o drop_fs2.o --- calcons_fs.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -DFASTS -c cal_consf.c -o calcons_fs.o --- faatran.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c faatran.c --- drop_fx.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropfx.c -o drop_fx.o --- drop_fz.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropfz2.c -o drop_fz.o --- drop_ff2.o --- --- droplnw.o --- --- drop_ff2.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c -DFASTF dropff2.c -o drop_ff2.o --- droplnw.o --- cc -O -I/usr/pkg/pthreads/include -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c dropnnw2.c -o droplnw.o --- lav2plt.o --- cc -O -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c lav2plt.c --- lavplt_ps.o --- --- lavplt_svg.o --- --- lavplt_ps.o --- cc -O -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c lavplt_ps.c --- lavplt_svg.o --- cc -O -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -c lavplt_svg.c --- map_db --- cc -O -DM10_CONS -DUNIX -DHAS_STDINT -DTIMES -DHZ=60 -DMAX_WORKERS=4 -DTHR_EXIT=pthread_exit -DPROGRESS -DFASTA_HOST='"your.host.here/fasta/cgi"' -DUSE_MMAP -o ../bin/map_db map_db.c --- fasta36 --- cc -O -o ../bin/fasta36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_fa.o drop_nfa.o wm_align.o calcons_fa.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- ssearch36 --- cc -O -o ../bin/ssearch36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_sw.o dropgsw2.o wm_align.o calcons_sw.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o pssm_asn_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- ggsearch36 --- cc -O -o ../bin/ggsearch36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_gnw.o dropgnw.o wm_align.o calcons_sw.o scale_sn.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o pssm_asn_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- lalign36 --- cc -O -o ../bin/lalign36 comp_mlib8.o compacc2_s.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o lshowalign.o htime.o apam.o doinit.o init_lal.o droplal2.o lsim4.o calcons_la.o scale_se.o karlin.o last_thresh.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o pssm_asn_subs.o -lm -lz --- fastm36 --- cc -O -o ../bin/fastm36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_fm.o drop_fm.o calcons_fm.o scaleswts.o last_tat.o tatstats_fm.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- tfastf36 --- cc -O -o ../bin/tfastf36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_tf.o drop_tff.o calcons_tff.o scaleswtf.o last_tat.o tatstats_ff.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o faatran.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- tfasts36 --- cc -O -o ../bin/tfasts36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_tfs.o drop_tfs.o calcons_tfs.o scaleswts.o last_tat.o tatstats_fs.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o faatran.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- tfastm36 --- cc -O -o ../bin/tfastm36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_s.o htime.o apam.o doinit.o init_tfm.o drop_tfm.o calcons_tfm.o scaleswts.o tatstats_fm.o last_tat.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o faatran.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- tfastx36 --- --- tfasty36 --- --- tfastx36 --- cc -O -o ../bin/tfastx36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_tfx.o drop_tfx.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o faatran.o url_subs.o mrandom.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- fasts36 --- --- tfasty36 --- cc -O -o ../bin/tfasty36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_tfy.o drop_tfz.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o faatran.o url_subs.o mrandom.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- fasts36 --- cc -O -o ../bin/fasts36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_fs.o drop_fs2.o calcons_fs.o scaleswts.o last_tat.o tatstats_fs.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- fastx36 --- cc -O -o ../bin/fastx36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_fx.o drop_fx.o faatran.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- fasty36 --- --- fastf36 --- --- fasty36 --- cc -O -o ../bin/fasty36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_fy.o drop_fz.o faatran.o scale_se.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- fastf36 --- cc -O -o ../bin/fastf36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_ff.o drop_ff2.o calcons_ff.o scaleswtf.o last_tat.o tatstats_ff.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o mrandom.o url_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- glsearch36 --- cc -O -o ../bin/glsearch36 comp_mthr8.o work_thr2.o pthr_subs2.o compacc2_t.o showbest.o build_ares.o re_getlib.o mshowalign2_t.o htime.o apam.o doinit.o init_lnw.o droplnw.o wm_align.o calcons_sw.o scale_sn.o karlin.o lgetlib.o lgetaa_m.o c_dispn.o ncbl2_mlib.o lib_sel.o url_subs.o mrandom.o pssm_asn_subs.o -lm -lz -L/usr/pkg/pthreads/lib -lpthread --- lav2svg --- cc -O -DUNIX -o ../bin/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm --- lav2ps --- cc -O -DUNIX -o ../bin/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm => Unwrapping files-to-be-installed.